Thermo Fisher Scientific

CE

- 최신 기술을 이용한 이용하여 높은 정확도를 제공하는 자동염기서열분석 시스템
- 데이터 분석량을 확장 및 축소 조절 가능
- 대량의 병렬 배열 기술을 적용한 반도체를 이용하여 DNA 복제 시 생성되는 수소 이온을 실시간으로 측정
- 소량(10ng) 또는 불완전한 샘플에서도 결과 확인 가능
- 매우 간편한 차세대 염기서열분석 워크플로우 제공

1. 염기서열분석기
- Read Length: 600bp 이상
- 최대 Throughput: 25Gb 이상
- 정확도: 99% 이상
- 분석 시간: 11.5h 이내
- 작동환경: 온도 15~30℃ 범위 내, 습도 10~80% 범위 내
- 데이터 포맷: FASTQ, SFF, BAM and VCF format outputs
- Application: RNA sequencing, De novo sequencing, Genome sequencing, Gene sequencing, ChIP-Seq, Methagenomics sequencing
- Processor: E5-2680 v4 이상
- RAM: 256GB 이상
- OS: Ubuntu™ or equivalent
- Storage: 24TB 이상

2. 염기서열분석 시료 준비 자동화 장비
- 시스템: Library PCR, Enrichment and chip 분주
- 적용가능시료: Genomic DNA, PCR product, RNA(cDNA)
- Chip 분주 자동화
- 실험 용량: 최대 2개 chip 용량의 염기서열 반도체 chip 장착 가능

3. 염기서열분석 QC 장비
- 시료의 염기서열 분석, 미생물 동정, DNA 단편 시료분석, Microsatellite 마커를 이용한 시료분석, SNaPShot, SSCP, CSCE, StockMaker를 이용한 단편분석
- NGS Data QC 및 NGS 분석 시 발생한 Gap의 위치를 효율적으로 분석
- 최대 6 개이상의 형광 염료를 동시에 검출하고 분석
- 사용자의 핸즈온타임 최소화
- QV 20 CRL * (최대 800bp)의 시퀀스 생성

4. 2차 데이터 분석 하드웨어
- 생성된 염기서열 Data를 저장 및 사용자의 편의에 맞게 가공하고 분석
- 맞춤형 변이 호출 및 germline variant filtering 알고리즘을 사용
- SNP, indel, CNV, 유전자 융합 및 이수성을 검출
- 대조군과 임상 연구 샘플을 혼합하여 각 릴리스를 검증