Life Technologies
Ion Proton
10년
주장비
분석
화합물 전처리·분석장비 > 입자분석장비 > 달리 분류되지 않는 입자분석장비
2014-01-15
318,273,850원
기관의뢰
고정형
기타
0원
모든 생명체의 기본이 되는 유전물질인 유전자를 위험한 방사능 동위원소 대신 반도체 chip을 이용하여 dNTP가 합성될 때마다 방출되는 수소이온을 검출하는 방식의 유전자 분석 장비로써 다양한 응용분야에 따라 소프트웨어에 의해 자동으로 분석해 주는 장비이다. 특히 모델 Ion Proton은 Laser나 lamp등의 light source가 필요 없으므로 상대적으로 발생되는 error 확률을 상당히 감소시켰으며, 사용되는 chip이 sequencer main 기능을 수행함으로써 사용이 용이하고, 유지보수가 쉽다. 또한, chip type에 따라 다양한 throughput을 선택할 수 있어, Amplicon sequencing부터 microbial sequencing, RNA-Seq, methylation, Gene Expression ChIP-Seq, Whole Transcriptomes, Human Exomes, Human Genomes 까지 다양한 실험에 적용이 가능하다. 또한 방대한 양의 data를 빠르게 처리할 수 있는 server 컴퓨터 및 분석 software를 제공함으로서 data 분석의 정확성과 편리함을 제공하고 있으므로, 기존의 NGS system에서는 불가능했던 단 하루만에 human genome sequencing을 할 수 있다는 장점을 가지고 있다.
1. Throughput : Up to 10 Gb
(Note: The Ion Proton™ II Chip will be available about six months after the Ion Proton™ I Chip. The Ion Proton™ II Chip will enable sample-to-variant analysis of a human genome in a single day, at up to 20x coverage.)
2. Read length : Up to 200-base fragment reads
3. Key applications
Human-scale genome sequencing Agricultural genome sequencing
Microbial genome sequencing Exome sequencing
Sequencing sets of genes Metagenomic sequencing
Methylation sequencing ChIP-Seq
Whole-transcriptome sequencing Gene-expression
Small-RNA sequencing MicroRNA sequencing
4. Available library solutions
Ion AmpliSeq™ Library Kit Ion TargetSeq™ Exome KitIon Xpress™ Plus Fragment Library Kit Ion Total RNA-Seq Kit
5. Barcoding solutions
384 barcodes supported by Torrent Suite
96 off-the-shelf barcodes for DNA
16 off-the-shelf barcodes for RNA
6. Software solutions
Torrent Suite Software utilizing Torrent Browser including TMAP alignment and Torrent Variant Caller for germline or somatic mutation detection.
7. Data formats : Industry standard FASTQ, SFF, and BAM format outputs