FTIR은 광원에서 나오는 모든 파장의 세기에 대한 정보를 포함하는 Interferogram을 사용하여 샘플을 측정하는 장치이다. IR spectroscopy는 분자의 진동을 이용한 분광학으로, 분자에 적외선을 쬐어주면 X-선이나 자외선 보다 에너지가 낮기 때문에 빛을 흡수하여 원자내 전자의 전이 현상을 일으키지 못하고, 대신 분자의 진동,회전,병진 운동등의 분자운동을 일으키게 된다. 따라서 분자의 진동에 의한 특성적 흡수 스펙트럼이 나타나는게 된다. IR을 쪼이면 진동을 일으키는 데 필요한 고유한 진동 주파수의 빛을 흡수하여 이 에너지에 대응하는 특성적인 적외선 스펙트럼을 얻어내어 시료를 분석하게 된다. 흡광도의 크기는 시료중 분자의 농도와 직접 연관되어 있으며, 스펙트럼 패턴은 고유의 뒤틀림, Band, 회전 및 각 원자들의 화학결합의 회전 및 진동 등 분자의 실제 구조를 반영한다.