CT(Computed Tomography)도 역시 Soft x-ray 장비와 마찬가지로 X선을 사용하고 있지만 3차원의 시료를 2차원의 영상으로 직접 필름에 감광시켜 이미지를 얻는 Soft X-ray 장치와는 달리 컴퓨터를 이용해 3차원 이미지 자료를 얻을 수 있다.

즉, CT는 주상시료의 한 단면 주위를 돌면서 X선을 투사하고 X선이 시료를 통과하면서 감소되는 양을 측정한다. 시료는 불규칙한 물질들로 구성되어 있어 밀도가 다르기 때문에 X선이 투사된 방향에 따라서 흡수하는 정도가 다르게 나타난다. X선이 투과된 정도를 컴퓨터로 분석하여 시료 내부의 각 구성물질의 밀도를 측정하고 이를 통하여 시료내부의 자세한 단면을 재구성해서 영상으로 나타나게 한다.
이러한 CT의 기능은 측정하고자 하는 대상에 대한 물리적인 손상이 없이 가능하기 때문에 인체에 대한 영상은 물론 물체에 대한 비파괴검사가 가능하도록 하여 현대에서는 해저퇴적물 시추시료나 가스하이드레이트 시료의 비파괴 검사에 널리 쓰인다.